15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2020 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2020  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  192  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1466  hypothetical protein  81.32 
 
 		 91 aa  163  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0844063  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0496  hypothetical protein  83.72 
 
 		 92 aa  160  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1263  hypothetical protein  80.22 
 
 		 91 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3483  hypothetical protein  78.02 
 
 		 91 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1131  hypothetical protein  77.91 
 
 		 89 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2947  hypothetical protein  71.43 
 
 		 86 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.46263  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5686  hypothetical protein  66.25 
 
 		 86 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1703  hypothetical protein  65 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1359  hypothetical protein  71.79 
 
 		 81 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337456  hitchhiker  0.00758752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0793  hypothetical protein  55.7 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2488  hypothetical protein  53.25 
 
 		 88 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3697  hypothetical protein  45.95 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0219  hypothetical protein  43.66 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.762197  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0102  hypothetical protein  33.78 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.14396e-73  hitchhiker  5.10513e-129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>