15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3483 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3483  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  191  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1263  hypothetical protein  87.91 
 
 		 91 aa  173  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.576583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1466  hypothetical protein  84.62 
 
 		 91 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0844063  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1131  hypothetical protein  82.76 
 
 		 89 aa  160  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0496  hypothetical protein  81.61 
 
 		 92 aa  158  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2020  hypothetical protein  78.02 
 
 		 91 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2947  hypothetical protein  71.79 
 
 		 86 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.46263  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5686  hypothetical protein  69.74 
 
 		 86 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1359  hypothetical protein  71.6 
 
 		 81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337456  hitchhiker  0.00758752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1703  hypothetical protein  66.23 
 
 		 80 aa  124  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0793  hypothetical protein  52.87 
 
 		 86 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.276266 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2488  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3697  hypothetical protein  47.3 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0219  hypothetical protein  42.25 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.762197  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0102  hypothetical protein  34.62 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.14396e-73  hitchhiker  5.10513e-129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>