13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4280 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4280  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  221  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4775  hypothetical protein  78.1 
 
 
115 aa  167  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430147  hitchhiker  0.000467683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2220  hypothetical protein  64.22 
 
 
113 aa  142  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.661755  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0385  hypothetical protein  64.37 
 
 
113 aa  124  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5495  PUR-alpha/beta/gamma DNA/RNA-binding  59.09 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  hitchhiker  0.00419912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1398  PUR-alpha/beta/gamma DNA/RNA-binding  62.03 
 
 
108 aa  100  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0161115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0665  hypothetical protein  62.65 
 
 
133 aa  100  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123576  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12938  hypothetical protein  56.63 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0382  hypothetical protein  54.88 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2199  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0046  hypothetical protein  37.18 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0650  hypothetical protein  41.89 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.221712 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0865  hypothetical protein  27.78 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>