13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5495 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5495  PUR-alpha/beta/gamma DNA/RNA-binding  100 
 
 		 141 aa  289  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  hitchhiker  0.00419912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2220  hypothetical protein  58.1 
 
 		 113 aa  124  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.661755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0385  hypothetical protein  60.23 
 
 		 113 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4280  hypothetical protein  52.78 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4775  hypothetical protein  57.47 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430147  hitchhiker  0.000467683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0665  hypothetical protein  57.32 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123576  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1398  PUR-alpha/beta/gamma DNA/RNA-binding  58.11 
 
 		 108 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0161115 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0382  hypothetical protein  61.33 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12938  hypothetical protein  44.04 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2199  hypothetical protein  52.7 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0046  hypothetical protein  40.28 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0650  hypothetical protein  45.59 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.221712 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0865  hypothetical protein  38.6 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>