13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2220 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2220  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  225  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.661755  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4775  hypothetical protein  66.04 
 
 
115 aa  146  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430147  hitchhiker  0.000467683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4280  hypothetical protein  64.22 
 
 
108 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0385  hypothetical protein  61.39 
 
 
113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5495  PUR-alpha/beta/gamma DNA/RNA-binding  58.82 
 
 
141 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  hitchhiker  0.00419912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1398  PUR-alpha/beta/gamma DNA/RNA-binding  62.96 
 
 
108 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0161115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0665  hypothetical protein  61.73 
 
 
133 aa  101  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123576  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0382  hypothetical protein  61.73 
 
 
125 aa  98.6  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12938  hypothetical protein  57.32 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2199  hypothetical protein  56.34 
 
 
127 aa  87.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.282933  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0650  hypothetical protein  47.76 
 
 
127 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.221712 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0046  hypothetical protein  37.33 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0865  hypothetical protein  25.71 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>