19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2821 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2821  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1721  hypothetical protein  57 
 
 
200 aa  244  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1045  hypothetical protein  57.5 
 
 
201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3076  hypothetical protein  53.77 
 
 
202 aa  237  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155263 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02995  hypothetical protein  55.56 
 
 
202 aa  228  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00430985  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0239  hypothetical protein  55.33 
 
 
200 aa  224  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0736  hypothetical protein  43.79 
 
 
224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1671  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1508  hypothetical protein  39.29 
 
 
239 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.821722  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0296  hypothetical protein  34.8 
 
 
216 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.219069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3405  hypothetical protein  43.67 
 
 
203 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2616  hypothetical protein  40.79 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0101  hypothetical protein  42.38 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0579  hypothetical protein  41.72 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2727  hypothetical protein  40.24 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0086  hypothetical protein  42.38 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1278  hypothetical protein  40.24 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0969  hypothetical protein  34.27 
 
 
217 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5533  glycosyl transferase family protein  46.26 
 
 
592 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1325  hypothetical protein  27.14 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>