19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3405 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3405  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  417  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1278  hypothetical protein  47.03 
 
 
225 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2727  hypothetical protein  45.41 
 
 
195 aa  165  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0296  hypothetical protein  43.98 
 
 
216 aa  157  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.219069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0579  hypothetical protein  49.08 
 
 
222 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2616  hypothetical protein  43.92 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0736  hypothetical protein  49.04 
 
 
224 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1671  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1508  hypothetical protein  43.17 
 
 
239 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.821722  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0086  hypothetical protein  48.03 
 
 
196 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5533  glycosyl transferase family protein  53.25 
 
 
592 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135062 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0101  hypothetical protein  48.03 
 
 
196 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0969  hypothetical protein  48.48 
 
 
217 aa  141  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3076  hypothetical protein  43.87 
 
 
202 aa  128  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155263 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02995  hypothetical protein  42.29 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00430985  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0239  hypothetical protein  42.68 
 
 
200 aa  124  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2821  hypothetical protein  43.67 
 
 
201 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1721  hypothetical protein  42.14 
 
 
200 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1045  hypothetical protein  41.03 
 
 
201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1325  hypothetical protein  27.04 
 
 
164 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>