18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1721 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1721  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  418  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1045  hypothetical protein  67.5 
 
 
201 aa  283  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3076  hypothetical protein  66.5 
 
 
202 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155263 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0239  hypothetical protein  67.84 
 
 
200 aa  277  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02995  hypothetical protein  65.35 
 
 
202 aa  267  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00430985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2821  hypothetical protein  57 
 
 
201 aa  244  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2616  hypothetical protein  43.6 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1278  hypothetical protein  46.3 
 
 
225 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2727  hypothetical protein  40.8 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0579  hypothetical protein  37.32 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3405  hypothetical protein  42.14 
 
 
203 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0736  hypothetical protein  44.74 
 
 
224 aa  121  7e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1671  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1508  hypothetical protein  43.92 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.821722  normal  0.704063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0296  hypothetical protein  39.2 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.219069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0101  hypothetical protein  40.94 
 
 
196 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0086  hypothetical protein  40.94 
 
 
196 aa  108  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0969  hypothetical protein  38.61 
 
 
217 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5533  glycosyl transferase family protein  46.94 
 
 
592 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>