21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16910 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16910  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  172  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331531  normal  0.123249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0085  hypothetical protein  65.91 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0262  hypothetical protein  56.32 
 
 		 93 aa  103  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.623777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0873  hypothetical protein  71.26 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3807  hypothetical protein  63.86 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1565  hypothetical protein  69.32 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.679201  hitchhiker  0.00228497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0296  hypothetical protein  56.82 
 
 		 88 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  63.86 
 
 		 99 aa  98.2  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3850  hypothetical protein  57.65 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0876589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3839  hypothetical protein  71.91 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01038  hypothetical protein  57.83 
 
 		 87 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0473132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5375  hypothetical protein  52.87 
 
 		 84 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13248  hypothetical protein  52.87 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4747  hypothetical protein  56.63 
 
 		 85 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1968  hypothetical protein  51.81 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128383  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3369  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  72.8  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3893  transcription termination factor Rho  34.67 
 
 		 663 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3879  transcription termination factor Rho  34.67 
 
 		 663 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.495548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3967  transcription termination factor Rho  34.67 
 
 		 663 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.625424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  47.73 
 
 		 691 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  54.55 
 
 		 684 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>