16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0085 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0085  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  177  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0296  hypothetical protein  59.77 
 
 
88 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0262  hypothetical protein  59.76 
 
 
93 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.623777 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0873  hypothetical protein  67.42 
 
 
89 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0159931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16910  hypothetical protein  65.91 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.331531  normal  0.123249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4747  hypothetical protein  63.1 
 
 
85 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917471  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1565  hypothetical protein  64.44 
 
 
90 aa  97.1  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.679201  hitchhiker  0.00228497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1968  hypothetical protein  61.9 
 
 
85 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128383  normal  0.238787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3839  hypothetical protein  64.77 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  54.12 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3807  hypothetical protein  53.49 
 
 
85 aa  89.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5375  hypothetical protein  49.44 
 
 
84 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01038  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  84  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0473132  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3850  hypothetical protein  51.76 
 
 
86 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0876589  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13248  hypothetical protein  49.44 
 
 
83 aa  79.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3369  hypothetical protein  47.56 
 
 
79 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>