20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04470  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  201  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.307211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1390  protein of unknown function DUF1540  64.71 
 
 		 102 aa  136  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0954882  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0354  hypothetical protein  59.41 
 
 		 102 aa  127  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.685578  normal  0.819916 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0477  protein of unknown function DUF1540  66.67 
 
 		 100 aa  127  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2453  hypothetical protein  62.5 
 
 		 99 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4060  protein of unknown function DUF1540  58.25 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.470876  normal  0.572624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0468  hypothetical protein  59.41 
 
 		 100 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00734316  normal  0.157634 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4815  hypothetical protein  51 
 
 		 98 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.458048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4365  hypothetical protein  51 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1770  protein of unknown function DUF1540  50 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3021  hypothetical protein  53.26 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3531  hypothetical protein  54.95 
 
 		 94 aa  90.5  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0370  hypothetical protein  45.36 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4237  hypothetical protein  45.36 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.868761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3089  hypothetical protein  39.6 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1185  hypothetical protein  37.62 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3590  hypothetical protein  43.16 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.212803 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1939  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19670  hypothetical protein  36.56 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2796  hypothetical protein  37.11 
 
 		 96 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>