21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3531 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3531  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  191  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3021  hypothetical protein  85.11 
 
 
94 aa  167  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0477  protein of unknown function DUF1540  62.07 
 
 
100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4060  protein of unknown function DUF1540  59.09 
 
 
100 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.470876  normal  0.572624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1770  protein of unknown function DUF1540  57.95 
 
 
96 aa  97.1  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4815  hypothetical protein  53.33 
 
 
98 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.458048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0468  hypothetical protein  52.17 
 
 
100 aa  94.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00734316  normal  0.157634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4365  hypothetical protein  52.22 
 
 
98 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1390  protein of unknown function DUF1540  50.55 
 
 
102 aa  90.9  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0954882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04470  hypothetical protein  54.95 
 
 
101 aa  90.5  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.307211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2453  hypothetical protein  52.81 
 
 
99 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0354  hypothetical protein  53.33 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.685578  normal  0.819916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4237  hypothetical protein  48.89 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.868761  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0370  hypothetical protein  43.33 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3089  hypothetical protein  40.91 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1185  hypothetical protein  39.77 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1939  hypothetical protein  42.05 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3590  hypothetical protein  43.75 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.212803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19670  hypothetical protein  41.77 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2796  hypothetical protein  37.78 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0082  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>