20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4237 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4237  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  192  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.868761  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0370  hypothetical protein  68.09 
 
 
94 aa  136  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1939  hypothetical protein  49.46 
 
 
111 aa  90.1  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1770  protein of unknown function DUF1540  53.33 
 
 
96 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0477  protein of unknown function DUF1540  44.44 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2453  hypothetical protein  48.94 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1390  protein of unknown function DUF1540  45.26 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0954882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1185  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3089  hypothetical protein  43.88 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4060  protein of unknown function DUF1540  43.01 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.470876  normal  0.572624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3590  hypothetical protein  42.11 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.212803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04470  hypothetical protein  45.36 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.307211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3531  hypothetical protein  48.89 
 
 
94 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4815  hypothetical protein  45.26 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.458048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4365  hypothetical protein  45.26 
 
 
98 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3021  hypothetical protein  44.44 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0468  hypothetical protein  41.49 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00734316  normal  0.157634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0354  hypothetical protein  42.55 
 
 
102 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.685578  normal  0.819916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2796  hypothetical protein  43.96 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19670  hypothetical protein  42.17 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>