20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1939 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1939  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4237  hypothetical protein  49.46 
 
 		 94 aa  90.1  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.868761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3089  hypothetical protein  42.55 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2796  hypothetical protein  46.24 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1185  hypothetical protein  40.43 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0370  hypothetical protein  43.01 
 
 		 94 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4365  hypothetical protein  43.43 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4815  hypothetical protein  43.43 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.458048 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4060  protein of unknown function DUF1540  39.18 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.470876  normal  0.572624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1770  protein of unknown function DUF1540  44.09 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0477  protein of unknown function DUF1540  36.08 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0468  hypothetical protein  38.95 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00734316  normal  0.157634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3531  hypothetical protein  42.05 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04470  hypothetical protein  39.39 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.307211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1390  protein of unknown function DUF1540  38.61 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0954882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3021  hypothetical protein  40.91 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.163091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2453  hypothetical protein  41.05 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0354  hypothetical protein  37.11 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.685578  normal  0.819916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3590  hypothetical protein  31.63 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.212803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19670  hypothetical protein  39.24 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>