15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2360 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2288  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  215  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2360  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  215  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000021243  normal  0.131368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2478  hypothetical protein  93.75 
 
 		 112 aa  205  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1968  hypothetical protein  86.24 
 
 		 110 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1676  hypothetical protein  66.07 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2610  hypothetical protein  67.26 
 
 		 114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2649  hypothetical protein  64.6 
 
 		 114 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2724  hypothetical protein  64.6 
 
 		 114 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.211978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1736  hypothetical protein  64.6 
 
 		 114 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2152  hypothetical protein  61.11 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1572  hypothetical protein  49.55 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0964  hypothetical protein  45.92 
 
 		 128 aa  87.4  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0782406  normal  0.0536827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02129  hypothetical protein  41.67 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.6002  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1051  hypothetical protein  32.93 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2181  hypothetical protein  31.76 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>