15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2478 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2478  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  224  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2288  hypothetical protein  90.18 
 
 		 110 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2360  hypothetical protein  90.18 
 
 		 110 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000021243  normal  0.131368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1676  hypothetical protein  66.96 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1968  hypothetical protein  76.58 
 
 		 110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2610  hypothetical protein  67.26 
 
 		 114 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2649  hypothetical protein  65.49 
 
 		 114 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2724  hypothetical protein  65.49 
 
 		 114 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.211978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1736  hypothetical protein  65.49 
 
 		 114 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2152  hypothetical protein  52.63 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1572  hypothetical protein  49.55 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0964  hypothetical protein  44.9 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0782406  normal  0.0536827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02129  hypothetical protein  41.24 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.6002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2181  hypothetical protein  32.14 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1051  hypothetical protein  32.93 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.434531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>