42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0722 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0722  P2 family phage major capsid protein  100 
 
 		 340 aa  706    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1284  P2 family phage major capsid protein  67.65 
 
 		 347 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0899  P2 family phage major capsid protein  52.96 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1028  major capsid protein  49.41 
 
 		 336 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2798  phage major capsid protein, P2 family  51.33 
 
 		 342 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3491  phage major capsid protein, P2 family  52.21 
 
 		 340 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.35706e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2934  phage major capsid protein P2 family  52.21 
 
 		 340 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.04671e-22 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1055  P2 family phage major capsid protein  48.22 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05027  hypothetical protein  48.35 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0941  P2 family phage major capsid protein  41.74 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2646  major capsid protein  39.1 
 
 		 334 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000224362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1350  P2 family phage major capsid protein  31.74 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01361  phage major capsid protein, P2 family  32.49 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0582174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1397  phage major capsid protein, P2  31.02 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0702  P2 family phage major capsid protein  30.99 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5054  P2 family phage major capsid protein  30.99 
 
 		 340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0357  P2 family phage major capsid protein  31.09 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0697  P2 family phage major capsid protein  30.33 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788074  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1937  bacteriophage protein  29.01 
 
 		 338 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3048  phage major capsid protein, P2 family  30.95 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000831709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2866  phage major capsid protein, P2 family  29.74 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2775  P2 family phage major capsid protein  30.36 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  decreased coverage  0.0000193345 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0926  P2 family phage major capsid protein  30.36 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0205  P2 family phage major capsid protein  29.49 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1470  P2 family phage major capsid protein  30.48 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.321687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2765  P2 family phage major capsid protein  30.48 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0241  phage major capsid protein, P2 family  30.49 
 
 		 344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2914  P2 family phage major capsid protein  28.48 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2643  phage major capsid protein, P2 family  28.62 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.22943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37590  Phage P2 major capsid precursor gpN-like protein  27.78 
 
 		 335 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2329  P2 family phage major capsid protein  29.58 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4325  phage major capsid protein GpN  30.19 
 
 		 357 aa  123  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3499  P2 family phage major capsid protein  28.3 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0440112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3173  phage major capsid protein, P2 family  29.02 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4837  P2 family phage major capsid protein  27.14 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3050  phage major capsid protein GpN  29.87 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3291  P2 family phage major capsid protein  27.57 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3831  phage major capsid protein, P2 family  28.27 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4366  phage major capsid protein P2 family  28.75 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000142704 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0771  phage major capsid protein  27.02 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0745  major capsid protein  28.98 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0585  P2 family phage major capsid protein  27.65 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>