42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_37590  Phage P2 major capsid precursor gpN-like protein  100 
 
 
335 aa  685    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1937  bacteriophage protein  67.07 
 
 
338 aa  471  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2914  P2 family phage major capsid protein  66.27 
 
 
334 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1350  P2 family phage major capsid protein  59.28 
 
 
337 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4837  P2 family phage major capsid protein  60 
 
 
341 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892596  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0205  P2 family phage major capsid protein  60.3 
 
 
339 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1397  phage major capsid protein, P2  59.88 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2329  P2 family phage major capsid protein  57.94 
 
 
351 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3173  phage major capsid protein, P2 family  58.19 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3291  P2 family phage major capsid protein  57.49 
 
 
335 aa  401  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3048  phage major capsid protein, P2 family  57.4 
 
 
352 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000831709 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2775  P2 family phage major capsid protein  57.4 
 
 
352 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  decreased coverage  0.0000193345 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0926  P2 family phage major capsid protein  57.4 
 
 
352 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3050  phage major capsid protein GpN  55.88 
 
 
357 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2866  phage major capsid protein, P2 family  57.4 
 
 
353 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4325  phage major capsid protein GpN  55.59 
 
 
357 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3499  P2 family phage major capsid protein  54.39 
 
 
364 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0440112 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01361  phage major capsid protein, P2 family  52.4 
 
 
338 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0582174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2643  phage major capsid protein, P2 family  49.56 
 
 
349 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.22943  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4366  phage major capsid protein P2 family  48.69 
 
 
386 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3831  phage major capsid protein, P2 family  42.23 
 
 
351 aa  280  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0357  P2 family phage major capsid protein  43.12 
 
 
342 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5054  P2 family phage major capsid protein  42.77 
 
 
340 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0702  P2 family phage major capsid protein  42.77 
 
 
340 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0697  P2 family phage major capsid protein  40 
 
 
344 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788074  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0771  phage major capsid protein  41.9 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0745  major capsid protein  36.94 
 
 
338 aa  215  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2765  P2 family phage major capsid protein  38.34 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1470  P2 family phage major capsid protein  38.34 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.321687  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0585  P2 family phage major capsid protein  37.46 
 
 
344 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0241  phage major capsid protein, P2 family  37.96 
 
 
344 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05027  hypothetical protein  31.64 
 
 
336 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3491  phage major capsid protein, P2 family  31.69 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35706e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2934  phage major capsid protein P2 family  31.69 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.04671e-22 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0899  P2 family phage major capsid protein  30.86 
 
 
343 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1055  P2 family phage major capsid protein  29.71 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1284  P2 family phage major capsid protein  28.91 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0722  P2 family phage major capsid protein  28.4 
 
 
340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1028  major capsid protein  28.53 
 
 
336 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2798  phage major capsid protein, P2 family  29.72 
 
 
342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2646  major capsid protein  29.63 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0941  P2 family phage major capsid protein  25.16 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>