42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1284 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1284  P2 family phage major capsid protein  100 
 
 
347 aa  722    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0722  P2 family phage major capsid protein  67.65 
 
 
340 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1028  major capsid protein  51.32 
 
 
336 aa  362  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2934  phage major capsid protein P2 family  54.2 
 
 
340 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.04671e-22 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3491  phage major capsid protein, P2 family  54.2 
 
 
340 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35706e-17 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0899  P2 family phage major capsid protein  53.71 
 
 
343 aa  358  9e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2798  phage major capsid protein, P2 family  52.63 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1055  P2 family phage major capsid protein  46.49 
 
 
340 aa  324  1e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05027  hypothetical protein  48.5 
 
 
336 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0941  P2 family phage major capsid protein  43.08 
 
 
390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2646  major capsid protein  39.81 
 
 
334 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0357  P2 family phage major capsid protein  34.12 
 
 
342 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1397  phage major capsid protein, P2  33.73 
 
 
339 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0702  P2 family phage major capsid protein  32.46 
 
 
340 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5054  P2 family phage major capsid protein  32.46 
 
 
340 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01361  phage major capsid protein, P2 family  31.87 
 
 
338 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0582174  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1937  bacteriophage protein  32.14 
 
 
338 aa  149  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2765  P2 family phage major capsid protein  33.44 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1470  P2 family phage major capsid protein  33.44 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.321687  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0205  P2 family phage major capsid protein  30.98 
 
 
339 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1350  P2 family phage major capsid protein  28.74 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0241  phage major capsid protein, P2 family  29.97 
 
 
344 aa  139  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4837  P2 family phage major capsid protein  29.41 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892596  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3048  phage major capsid protein, P2 family  30.56 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000831709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0771  phage major capsid protein  29.85 
 
 
344 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3291  P2 family phage major capsid protein  30.19 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2775  P2 family phage major capsid protein  29.94 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  decreased coverage  0.0000193345 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0926  P2 family phage major capsid protein  30.03 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2866  phage major capsid protein, P2 family  30.12 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0697  P2 family phage major capsid protein  29.57 
 
 
344 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2914  P2 family phage major capsid protein  29.57 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37590  Phage P2 major capsid precursor gpN-like protein  28.02 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4325  phage major capsid protein GpN  30.03 
 
 
357 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0745  major capsid protein  28.61 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2329  P2 family phage major capsid protein  29.19 
 
 
351 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3050  phage major capsid protein GpN  29.73 
 
 
357 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0585  P2 family phage major capsid protein  28.37 
 
 
344 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2643  phage major capsid protein, P2 family  27.74 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.22943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3831  phage major capsid protein, P2 family  26.79 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4366  phage major capsid protein P2 family  28.19 
 
 
386 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3499  P2 family phage major capsid protein  28.86 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0440112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3173  phage major capsid protein, P2 family  27.71 
 
 
375 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>