42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0205 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0205  P2 family phage major capsid protein  100 
 
 
339 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4837  P2 family phage major capsid protein  77.13 
 
 
341 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892596  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1350  P2 family phage major capsid protein  64.09 
 
 
337 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1397  phage major capsid protein, P2  59.88 
 
 
339 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1937  bacteriophage protein  60.36 
 
 
338 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37590  Phage P2 major capsid precursor gpN-like protein  60.3 
 
 
335 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01361  phage major capsid protein, P2 family  56.85 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0582174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2914  P2 family phage major capsid protein  57.53 
 
 
334 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3291  P2 family phage major capsid protein  57.01 
 
 
335 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3173  phage major capsid protein, P2 family  55.56 
 
 
375 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2329  P2 family phage major capsid protein  53.01 
 
 
351 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3499  P2 family phage major capsid protein  54.09 
 
 
364 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0440112 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4325  phage major capsid protein GpN  52.72 
 
 
357 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3050  phage major capsid protein GpN  52.91 
 
 
357 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0926  P2 family phage major capsid protein  52.71 
 
 
352 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2775  P2 family phage major capsid protein  53.51 
 
 
352 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  decreased coverage  0.0000193345 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3048  phage major capsid protein, P2 family  53.22 
 
 
352 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000831709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2866  phage major capsid protein, P2 family  52.56 
 
 
353 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2643  phage major capsid protein, P2 family  52.01 
 
 
349 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.22943  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4366  phage major capsid protein P2 family  47.71 
 
 
386 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3831  phage major capsid protein, P2 family  42.82 
 
 
351 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0702  P2 family phage major capsid protein  40.36 
 
 
340 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5054  P2 family phage major capsid protein  40.36 
 
 
340 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0357  P2 family phage major capsid protein  40.06 
 
 
342 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0745  major capsid protein  36.87 
 
 
338 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0771  phage major capsid protein  40.99 
 
 
344 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0697  P2 family phage major capsid protein  35.22 
 
 
344 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788074  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0241  phage major capsid protein, P2 family  37.85 
 
 
344 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0585  P2 family phage major capsid protein  36.98 
 
 
344 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1470  P2 family phage major capsid protein  35.47 
 
 
341 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.321687  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2765  P2 family phage major capsid protein  35.47 
 
 
341 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1284  P2 family phage major capsid protein  31.16 
 
 
347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05027  hypothetical protein  29.53 
 
 
336 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0722  P2 family phage major capsid protein  29.6 
 
 
340 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0899  P2 family phage major capsid protein  28.66 
 
 
343 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2798  phage major capsid protein, P2 family  28.65 
 
 
342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2934  phage major capsid protein P2 family  28.44 
 
 
340 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.04671e-22 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3491  phage major capsid protein, P2 family  28.44 
 
 
340 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35706e-17 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1055  P2 family phage major capsid protein  28.24 
 
 
340 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1028  major capsid protein  28.8 
 
 
336 aa  116  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2646  major capsid protein  28.15 
 
 
334 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0941  P2 family phage major capsid protein  26.2 
 
 
390 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>