29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2122 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2122  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
152 aa  314  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00602064  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2300  GCN5-related N-acetyltransferase  96.05 
 
 
152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  94.08 
 
 
152 aa  298  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0189779  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2224  acetyltransferase  91.45 
 
 
152 aa  291  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  68.42 
 
 
152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00744799  normal  0.0955492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  68.42 
 
 
152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  67.76 
 
 
152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1946  GCN5-related N-acetyltransferase  67.11 
 
 
152 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00699683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1953  GCN5-related N-acetyltransferase  66.45 
 
 
152 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0147543  normal  0.487286 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3176  hypothetical protein  39.07 
 
 
154 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5777  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2319  hypothetical protein  31.17 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0136635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0792  acetyltransferase (GNAT) family protein  33.58 
 
 
167 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00131347  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1138  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0776  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2146  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9961  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170706  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2640  acetyltransferase  25.5 
 
 
152 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0175  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00511225  normal  0.329123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0180  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01471  hypothetical protein  23.97 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3271  GCN5-related N-acetyltransferase  29.77 
 
 
292 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1261  putative acetyltransferase  33.77 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3643  acetyltransferase, GNAT family  33.72 
 
 
285 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2003  putative acetyltransferase  32.47 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.408037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2234  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  33.67 
 
 
314 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.406017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>