70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3176 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3176  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  314  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2224  acetyltransferase  40 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5777  GCN5-related N-acetyltransferase  43.07 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2300  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2122  GCN5-related N-acetyltransferase  39.07 
 
 		 152 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00602064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0189779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1953  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0147543  normal  0.487286 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00744799  normal  0.0955492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1946  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00699683  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2319  hypothetical protein  34.25 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0136635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0792  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.55 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00131347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0776  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1138  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01471  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0180  GCN5-related N-acetyltransferase  24.6 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0175  GCN5-related N-acetyltransferase  24.6 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00511225  normal  0.329123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2146  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2640  acetyltransferase  36.47 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0491515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2437  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0974186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  33.33 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6642  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.0657736 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  43.18 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0785  putative acetyltransferase  39.78 
 
 		 296 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.67 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 290 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003294  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6702  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0245  acetyltransferase, GNAT family  29.7 
 
 		 285 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  34.4 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.735918  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6226  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0286732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3965  hypothetical protein  31.36 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.819942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3838  hypothetical protein  31.36 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4026  hypothetical protein  31.36 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.87 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3857  hypothetical protein  31.36 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  31.96 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  36.45 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  32.94 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6142  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.189087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  34.83 
 
 		 320 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  27.68 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0160  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 		 285 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  34.15 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1864  acetyltransferase, GNAT family  25.56 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3922  hypothetical protein  30.51 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.768766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 		 166 aa  41.2  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1857  acetyltransferase  32.47 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1139  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.64 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  32.97 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  29.89 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2631  acetyltransferase protein  30 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.170274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2124  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1679  acetyltransferase  26.15 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00221151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>