52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2319 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2319  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  304  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0136635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3176  hypothetical protein  34.25 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2300  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2224  acetyltransferase  32.47 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0189779  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2122  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00602064  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5777  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1946  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00699683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00744799  normal  0.0955492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1953  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0147543  normal  0.487286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0180  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0175  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00511225  normal  0.329123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2640  acetyltransferase  33.64 
 
 
152 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1138  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170706  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2146  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9961  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0776  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0792  acetyltransferase (GNAT) family protein  31 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00131347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1013  acetyltransferase  28.08 
 
 
167 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1085  acetyltransferase  28.08 
 
 
167 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.919311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01471  hypothetical protein  28.75 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1163  acetyltransferase, GNAT family  27.03 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  27.88 
 
 
159 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2850  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
175 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003294  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0855  GNAT family acetyltransferase  32.5 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0370  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.550464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4189  acetyltransferase, GNAT family  26.35 
 
 
169 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.248105  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  36 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0999  acetyltransferase  27.03 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  23.66 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  26.72 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1117  acetyltransferase, GNAT family  26.35 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1002  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26100  predicted acetyltransferase  25.55 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
166 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0245  acetyltransferase, GNAT family  25.44 
 
 
285 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  21.97 
 
 
163 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4130  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.39 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0785  putative acetyltransferase  25.51 
 
 
296 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6093  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
294 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335222  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  23.97 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0160  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
285 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6702  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869276 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2131  diamine acetyltransferase 2  27.73 
 
 
156 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000287953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>