15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1945 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1890  hypothetical protein  94.74 
 
 		 399 aa  786    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.133556  normal  0.775497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2088  hypothetical protein  94.24 
 
 		 399 aa  782    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.450369 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1945  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  828    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2374  hypothetical protein  73.19 
 
 		 364 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2087  hypothetical protein  72.21 
 
 		 383 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.658279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1851  hypothetical protein  69.59 
 
 		 386 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2022  hypothetical protein  69.01 
 
 		 364 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2583  hypothetical protein  71.12 
 
 		 366 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.571269  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2192  hypothetical protein  58.38 
 
 		 376 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000550171  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1895  hypothetical protein  58.95 
 
 		 332 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000802  hypothetical protein  42.04 
 
 		 362 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0874  hypothetical protein  40.12 
 
 		 380 aa  245  9e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00736429  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06701  hypothetical protein  40.24 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0276  hypothetical protein  52.27 
 
 		 140 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0277  hypothetical protein  34.56 
 
 		 261 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>