15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2022 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2022  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  755    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2374  hypothetical protein  76.94 
 
 		 364 aa  585  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274482  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2583  hypothetical protein  77.32 
 
 		 366 aa  578  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.571269  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2087  hypothetical protein  78.09 
 
 		 383 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.658279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1945  hypothetical protein  69.01 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2088  hypothetical protein  71.12 
 
 		 399 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.450369 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1890  hypothetical protein  70.82 
 
 		 399 aa  501  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.133556  normal  0.775497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1851  hypothetical protein  69.32 
 
 		 386 aa  503  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2192  hypothetical protein  61.56 
 
 		 376 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000550171  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1895  hypothetical protein  62.04 
 
 		 332 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000802  hypothetical protein  41.29 
 
 		 362 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135693  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06701  hypothetical protein  39.47 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0874  hypothetical protein  42.26 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00736429  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0277  hypothetical protein  40.53 
 
 		 261 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0276  hypothetical protein  53.38 
 
 		 140 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>