15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0874 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0874  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  790    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00736429  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000802  hypothetical protein  55.15 
 
 		 362 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135693  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06701  hypothetical protein  57.1 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2087  hypothetical protein  42.86 
 
 		 383 aa  269  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.658279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2374  hypothetical protein  41.64 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274482  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1895  hypothetical protein  43.93 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2088  hypothetical protein  38.16 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.450369 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1890  hypothetical protein  37.89 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.133556  normal  0.775497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1945  hypothetical protein  40.12 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1851  hypothetical protein  43.05 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2022  hypothetical protein  42.26 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0277  hypothetical protein  57.21 
 
 		 261 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2583  hypothetical protein  39.56 
 
 		 366 aa  238  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.571269  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2192  hypothetical protein  38.48 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000550171  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0276  hypothetical protein  59.38 
 
 		 140 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>