53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1775 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1775  YebG family protein  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.204874  normal  0.14281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1670  YebG family protein  95.96 
 
 		 99 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0114857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1745  YebG family protein  95.96 
 
 		 99 aa  191  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2604  hypothetical protein  88.89 
 
 		 99 aa  180  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2563  YebG family protein  83.84 
 
 		 99 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.522632  normal  0.0746141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2443  YebG family protein  83.84 
 
 		 99 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046896  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2205  YebG family protein  87.06 
 
 		 99 aa  155  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.403262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1901  YebG family protein  90.36 
 
 		 99 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0490099  normal  0.264637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2450  YebG family protein  90.36 
 
 		 99 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2231  YebG family protein  84.62 
 
 		 97 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2130  YebG family protein  68.09 
 
 		 94 aa  128  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0021686  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1582  hypothetical protein  65.26 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.373474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1719  YebG  64.95 
 
 		 99 aa  120  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2486  YebG family protein  62.77 
 
 		 94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000469742  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1932  YebG family protein  63.64 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1799  YebG family protein  74.32 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.104805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2349  hypothetical protein  48.04 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2445  YebG family protein  48.04 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1632  hypothetical protein  48.04 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2803  YebG family protein  55.41 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316199 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1887  YebG family protein  52.05 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03780  YebG family protein  47.3 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03306  hypothetical protein  58.82 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2078  DNA damage-inducible protein YebG  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1784  DNA damage-inducible protein YebG  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1793  YebG family protein  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0398678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1339  DNA damage-inducible protein YebG  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2583  DNA damage-inducible protein YebG  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01807  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1940  DNA damage-inducible protein YebG  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01819  conserved protein regulated by LexA  42.11 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1908  hypothetical protein  54.17 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1367  DNA damage-inducible protein YebG  42.55 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1242  DNA damage-inducible protein YebG  42.55 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2041  DNA damage-inducible protein YebG  42.55 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.968933  normal  0.344242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2096  DNA damage-inducible protein YebG  42.55 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.387905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2036  DNA damage-inducible protein YebG  42.55 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0676  hypothetical protein  52.94 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.371431  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3691  YebG family protein  42.16 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4298  hypothetical protein  45.59 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1244  hypothetical protein  42.53 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2220  YebG family protein  53.45 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00285883  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002680  hypothetical protein  57.69 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2961  hypothetical protein  32.95 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.50434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1714  hypothetical protein  39.29 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19950  hypothetical protein  39.29 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3241  YebG family protein  39.58 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2123  YebG protein  34.25 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4600  YebG family protein  36.36 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4616  YebG family protein  35.71 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4476  YebG family protein  35.71 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.21076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0674  hypothetical protein  33.78 
 
 		 97 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000978777  hitchhiker  0.000000170908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0822  YebG family protein  35.71 
 
 		 87 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>