25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0674 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0674  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  191  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000978777  hitchhiker  0.000000170908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0916  YebG  45.45 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4600  YebG family protein  43.53 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4476  YebG family protein  42.35 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.21076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19950  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146947  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4616  YebG family protein  42.35 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0822  YebG family protein  42.35 
 
 		 87 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1714  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3241  YebG family protein  41.38 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1033  YebG  42.86 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1197  hypothetical protein  42.05 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2961  hypothetical protein  39.53 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.50434  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1582  hypothetical protein  40.24 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.373474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1932  YebG family protein  37.84 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2205  YebG family protein  34.62 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.403262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2604  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1745  YebG family protein  34.62 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1670  YebG family protein  34.62 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0114857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1901  YebG family protein  34.62 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0490099  normal  0.264637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2450  YebG family protein  34.62 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.809515  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2443  YebG family protein  35.14 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.046896  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2563  YebG family protein  35.14 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.522632  normal  0.0746141 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1799  YebG family protein  36.49 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.104805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2486  YebG family protein  33.78 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000469742  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1775  YebG family protein  33.78 
 
 		 99 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.204874  normal  0.14281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>