37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4616 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4616  YebG family protein  100 
 
 		 87 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4476  YebG family protein  100 
 
 		 87 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.21076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4600  YebG family protein  97.7 
 
 		 87 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0822  YebG family protein  95.4 
 
 		 87 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0916  YebG  87.21 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1714  hypothetical protein  83.91 
 
 		 88 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3241  YebG family protein  83.53 
 
 		 87 aa  144  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19950  hypothetical protein  82.76 
 
 		 88 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1197  hypothetical protein  60.98 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1033  YebG  59.76 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0674  hypothetical protein  42.35 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000978777  hitchhiker  0.000000170908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2961  hypothetical protein  37.36 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.50434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2220  YebG family protein  42.11 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00285883  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2803  YebG family protein  39.19 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1632  hypothetical protein  36.25 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2349  hypothetical protein  37.84 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2445  YebG family protein  37.84 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03780  YebG family protein  37.78 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4298  hypothetical protein  37.31 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2231  YebG family protein  37.5 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.266677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1932  YebG family protein  41.67 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511899  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1719  YebG  36.51 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1908  hypothetical protein  40.91 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1244  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2583  DNA damage-inducible protein YebG  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1339  DNA damage-inducible protein YebG  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1784  DNA damage-inducible protein YebG  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01819  conserved protein regulated by LexA  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01807  hypothetical protein  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2078  DNA damage-inducible protein YebG  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1940  DNA damage-inducible protein YebG  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1793  YebG family protein  35.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0398678  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03306  hypothetical protein  39.39 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1775  YebG family protein  35.71 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.204874  normal  0.14281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3691  YebG family protein  36.11 
 
 		 139 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1745  YebG family protein  35.71 
 
 		 99 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.374058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1670  YebG family protein  35.71 
 
 		 99 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0114857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>