16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3689 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3689  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  303  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4725  hypothetical protein  56.55 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3885  hypothetical protein  61.49 
 
 		 154 aa  173  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4323  hypothetical protein  55.17 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4463  hypothetical protein  55.17 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4268  hypothetical protein  55.17 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0076  hypothetical protein  55.17 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.928332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3973  hypothetical protein  56.38 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3880  hypothetical protein  56.55 
 
 		 151 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4083  hypothetical protein  56.55 
 
 		 151 aa  163  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4103  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3923  hypothetical protein  51.02 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0079  hypothetical protein  50.33 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0211  hypothetical protein  46.3 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0118  hypothetical protein  48.37 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0118  hypothetical protein  45.52 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.453663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>