16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4725 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4725  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  306  8e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3973  hypothetical protein  86.09 
 
 
151 aa  253  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4083  hypothetical protein  85.43 
 
 
151 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3880  hypothetical protein  84.77 
 
 
151 aa  250  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0076  hypothetical protein  77.48 
 
 
151 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.928332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4323  hypothetical protein  76.82 
 
 
151 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4463  hypothetical protein  76.82 
 
 
151 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4268  hypothetical protein  76.82 
 
 
151 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3885  hypothetical protein  68.21 
 
 
154 aa  225  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3689  hypothetical protein  56.55 
 
 
150 aa  174  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3923  hypothetical protein  56.95 
 
 
152 aa  174  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4103  hypothetical protein  54.73 
 
 
152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0211  hypothetical protein  49.39 
 
 
164 aa  157  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0118  hypothetical protein  48.72 
 
 
160 aa  147  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159362  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0079  hypothetical protein  48.99 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0118  hypothetical protein  47.95 
 
 
145 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.453663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>