16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4083 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4083  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  308  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3880  hypothetical protein  98.68 
 
 
151 aa  304  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3973  hypothetical protein  94.7 
 
 
151 aa  274  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4725  hypothetical protein  85.43 
 
 
151 aa  269  8.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0076  hypothetical protein  79.05 
 
 
151 aa  251  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.928332  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4323  hypothetical protein  79.05 
 
 
151 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4463  hypothetical protein  79.05 
 
 
151 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4268  hypothetical protein  79.05 
 
 
151 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3885  hypothetical protein  65.56 
 
 
154 aa  219  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3689  hypothetical protein  56.55 
 
 
150 aa  175  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4103  hypothetical protein  52.7 
 
 
152 aa  169  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3923  hypothetical protein  55.86 
 
 
152 aa  164  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0211  hypothetical protein  48.73 
 
 
164 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0079  hypothetical protein  48.99 
 
 
162 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0118  hypothetical protein  51.37 
 
 
145 aa  142  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0118  hypothetical protein  46.79 
 
 
160 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0159362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>