16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1018 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1018  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000940491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1096  hypothetical protein  62.82 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0307169  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1204  hypothetical protein  61.73 
 
 		 169 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2888  hypothetical protein  65.07 
 
 		 151 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.58238  hitchhiker  0.0000034338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2970  hypothetical protein  65.07 
 
 		 151 aa  193  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0490027  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3066  hypothetical protein  65.07 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0415065  decreased coverage  0.0000000174496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1165  hypothetical protein  61.38 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.798493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1209  hypothetical protein  60.27 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.799807  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1242  hypothetical protein  60.27 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.45898  normal  0.329943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3148  hypothetical protein  60.69 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0171848  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1305  hypothetical protein  63.7 
 
 		 151 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1124  hypothetical protein  62.76 
 
 		 147 aa  177  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0986  hypothetical protein  63.08 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2814  hypothetical protein  53.85 
 
 		 163 aa  163  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.18197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2975  hypothetical protein  51.63 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.764373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0844  hypothetical protein  51.49 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>