17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2970 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2970  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0490027  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2888  hypothetical protein  99.34 
 
 		 151 aa  295  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.58238  hitchhiker  0.0000034338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3066  hypothetical protein  98.68 
 
 		 151 aa  295  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0415065  decreased coverage  0.0000000174496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1305  hypothetical protein  90.07 
 
 		 151 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1242  hypothetical protein  80.79 
 
 		 151 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.45898  normal  0.329943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1209  hypothetical protein  80.79 
 
 		 151 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.799807  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1165  hypothetical protein  80.54 
 
 		 149 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.798493  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3148  hypothetical protein  80.54 
 
 		 149 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0171848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1124  hypothetical protein  81.33 
 
 		 147 aa  223  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.537347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1204  hypothetical protein  60.14 
 
 		 169 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36812  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2814  hypothetical protein  63.95 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.18197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1096  hypothetical protein  65.41 
 
 		 172 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0307169  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1018  hypothetical protein  65.07 
 
 		 157 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000940491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0986  hypothetical protein  59.23 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2975  hypothetical protein  53.85 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.764373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0844  hypothetical protein  53.24 
 
 		 140 aa  144  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  34.33 
 
 		 423 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>