242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11670 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11670  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.334488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0042  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446717  normal  0.0208603 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09040  tRNA-Glu  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.431816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  91.84 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  91.84 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12300  tRNA-Glu  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0102147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0046  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0021  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.349986  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0045  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14035  tRNA-Glu  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00157329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06180  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.75789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0084  tRNA-Glu  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0019  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0030  tRNA-Glu  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000166149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1796  tRNA-Glu  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00073  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101192  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0112  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000205577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0090  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0089  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000367651  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0022  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.572486  hitchhiker  0.00000059439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5097  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000188223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4686  tRNA-Glu  85 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0982037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t065  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t068  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0087  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0086  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0097  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121483  normal  0.112474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0095  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00314986  normal  0.201708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0096  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00116613  normal  0.111863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0098  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000377978  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0023  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  unclonable  0.0000000304821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0085  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000107355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5082  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0023409  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0066  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0067  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000412805  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0068  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0069  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000472024  normal  0.658468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0070  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000548592  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5055  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0897941  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0061  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0063  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000126718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0064  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000354559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0065  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0066  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000460024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0067  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0068  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000473191  normal  0.85687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0019  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0075  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0023  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770759  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0024  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229893  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0008  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.029159  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0067  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000550936  normal  0.0102746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0087  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00145961  normal  0.0492727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0107  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0341166  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0069  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0164971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0070  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00169817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0071  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000687617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0072  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0073  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000261854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0074  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0076  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5105  tRNA-Glu  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4721  tRNA-Glu  85 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00309501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4716  tRNA-Glu  85 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000625265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4707  tRNA-Glu  85 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000513292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>