51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0042 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0042  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446717  normal  0.0208603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11670  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.334488 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12300  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0102147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0084  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06180  tRNA-Glu  85 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.75789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09040  tRNA-Glu  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.431816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0014  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807422  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0012  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0059  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.327246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0033  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0516198  hitchhiker  0.000000402532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0002  tRNA-Glu  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.509318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0059  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.872199  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0072  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.514054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0056  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0015  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0006  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0058  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.069455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0056  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0046  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0052  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0061  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180901  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0015  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.652261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0053  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.526279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0005  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00334016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0032  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.449659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0046  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000283736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0062  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.216976  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0034  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0629823  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0060  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.790027  normal  0.68606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>