28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12300 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_12300  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0102147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0042  tRNA-Glu  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446717  normal  0.0208603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11670  tRNA-Glu  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.334488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0019  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0050  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0047  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877641  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0046  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0052  tRNA-Glu  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09040  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.431816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34010  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.284833  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0010  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11080  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18590  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.2903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0045  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.427459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0046  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.404692  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0035  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0036  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.661246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0055  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0052  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.822673  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0051  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.63793  hitchhiker  0.00823145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18600  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.204503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0015  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.879975  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0047  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.792355  normal  0.693567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0013  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0017  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0013  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0014  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.206321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0016  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.671374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>