20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2826 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2826  CRISPR-associated Cse2 family protein  100 
 
 		 159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1897  CRISPR-associated protein, Cse2 family  46.5 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17190  CRISPR-associated Cse2 family protein  40.57 
 
 		 182 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.895123  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0649  CRISPR-associated Cse2 family protein  36.36 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3759  CRISPR-associated Cse2 family protein  37.13 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4092  CRISPR-associated protein, Cse2 family  35.33 
 
 		 190 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2440  CRISPR-associated protein, Cse2 family  30.46 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2341  CRISPR-associated Cse2 family protein  32.47 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0924  CRISPR-associated protein, Cse2 family  33.12 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1231  CRISPR-associated protein, Cse2 family  30.17 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000156485  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3018  Cse2 family CRISPR-associated protein  32.43 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000251267  normal  0.0643153 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0987  CRISPR-associated protein, Cse2 family  31.37 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0828  hypothetical protein  32.48 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0019  hypothetical protein  31.61 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.570283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2672  CRISPR-associated protein, Cse2 family  25.32 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1591  hypothetical protein  23.59 
 
 		 244 aa  44.3  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0942  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.78 
 
 		 722 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2631  hypothetical protein  34.62 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.930779  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3908  CRISPR-associated protein, Cse2 family  24.69 
 
 		 223 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000211783  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1599  CRISPR-associated Cse2 family protein  26.95 
 
 		 214 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0275986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>