57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2487 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2487  ISGsu1, transposase  100 
 
 		 179 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0986  putative transposase  45.52 
 
 		 376 aa  141  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2974  transposase IS4 family protein  43.05 
 
 		 312 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2646  transposase IS4 family protein  43.05 
 
 		 372 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2344  transposase IS4 family protein  42.38 
 
 		 261 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.718047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2141  ISGsu1, transposase, interruption  41.22 
 
 		 362 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0299  ISGsu1, transposase  41.22 
 
 		 372 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0252  ISGsu1, transposase  41.22 
 
 		 372 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.423993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2180  ISGsu1, transposase  41.22 
 
 		 372 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0957  ISGsu1, transposase  41.22 
 
 		 372 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3447  transposase IS4  34.59 
 
 		 389 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3183  transposase IS4  34.59 
 
 		 389 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3141  transposase IS4  34.59 
 
 		 389 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3039  transposase IS4  34.59 
 
 		 389 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000331814  normal  0.984797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2507  transposase IS4  34.59 
 
 		 389 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2386  transposase IS4  34.59 
 
 		 389 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1683  transposase IS4  34.59 
 
 		 389 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000475694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1315  transposase IS4  34.59 
 
 		 389 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0140  transposase, IS4 family protein  34.39 
 
 		 389 aa  91.3  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.745984  n/a   
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3567  transposase IS4  33.96 
 
 		 389 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2093  transposase IS4  33.96 
 
 		 389 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2223  transposase IS4  41.61 
 
 		 389 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.285308  normal  0.571436 
 
 
-
 
NC_002950  PG2194  ISPg4, transposase  35.77 
 
 		 385 aa  90.5  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0050  ISPg4, transposase  35.77 
 
 		 385 aa  90.5  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1658  ISPg4, transposase  35.77 
 
 		 385 aa  90.5  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.198314 
 
 
-
 
NC_002950  PG0177  ISPg4, transposase  35.77 
 
 		 385 aa  90.5  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0970  ISPg4, transposase  35.77 
 
 		 385 aa  90.5  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.309605 
 
 
-
 
NC_002950  PG0487  ISPg4, transposase  35.77 
 
 		 385 aa  90.5  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0225  ISPg4, transposase  35.77 
 
 		 385 aa  90.5  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0019  ISPg4 transposase  35.77 
 
 		 385 aa  90.1  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.808263 
 
 
-
 
NC_002950  PG1261  ISPg4, transposase  35.77 
 
 		 385 aa  90.1  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1673  ISPg4, transposase  35.77 
 
 		 385 aa  90.1  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.185706 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0350  transposase IS4 family protein  35.56 
 
 		 382 aa  87.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1836  transposase, IS4 family protein  36.15 
 
 		 389 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2339  transposase, IS4 family protein  36.15 
 
 		 389 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1138  transposase, IS4  44 
 
 		 389 aa  84.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2370  transposase IS4 family protein  34.81 
 
 		 389 aa  84.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5422  IS4 family transposase  37.01 
 
 		 389 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.219241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0509  transposase IS4 family protein  36.07 
 
 		 381 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0772109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0552  transposase IS4 family protein  36.07 
 
 		 381 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0870  transposase IS4 family protein  36.07 
 
 		 381 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100589  normal  0.585839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2900  transposase IS4 family protein  36.07 
 
 		 381 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00460334  normal  0.33461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6486  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0808322  normal  0.416225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4154  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4150  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.277384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3953  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.353815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3686  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4418  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000316762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5490  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0292908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5869  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5316  transposase IS4 family protein  31.45 
 
 		 412 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.823391 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0015  transposase, IS4 family protein  48.65 
 
 		 252 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3568  transposase IS4 family protein  28.8 
 
 		 414 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2744  transposase IS4 family protein  28.8 
 
 		 414 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000679967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2289  transposase IS4 family protein  28.8 
 
 		 414 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000925206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1140  transposase IS4 family protein  28.8 
 
 		 414 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000344199  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3996  transposase IS4 family protein  28.95 
 
 		 414 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>