17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0740 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0740  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  339  9e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000203019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0839  hypothetical protein  89.76 
 
 		 170 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0608966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3560  hypothetical protein  82.53 
 
 		 166 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0893278  normal  0.150647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0784  hypothetical protein  81.93 
 
 		 166 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.484963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3182  hypothetical protein  81.93 
 
 		 166 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  0.0231359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0682  hypothetical protein  82.53 
 
 		 166 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0676742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3628  hypothetical protein  82.53 
 
 		 166 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3751  hypothetical protein  82.53 
 
 		 166 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3848  hypothetical protein  81.33 
 
 		 166 aa  279  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0756  hypothetical protein  80.72 
 
 		 166 aa  278  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.219029  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0788  hypothetical protein  80.12 
 
 		 166 aa  276  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3512  hypothetical protein  80.12 
 
 		 166 aa  276  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0908  hypothetical protein  75.9 
 
 		 185 aa  269  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2617  hypothetical protein  74.7 
 
 		 167 aa  265  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.808132  normal  0.759725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2970  hypothetical protein  77.11 
 
 		 166 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00567056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3180  hypothetical protein  70.48 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 383 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>