16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3180 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3180  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  338  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0908  hypothetical protein  80.12 
 
 		 185 aa  275  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3512  hypothetical protein  75.3 
 
 		 166 aa  257  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2970  hypothetical protein  73.49 
 
 		 166 aa  253  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00567056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0839  hypothetical protein  72.29 
 
 		 170 aa  248  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0608966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3560  hypothetical protein  70.48 
 
 		 166 aa  245  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0893278  normal  0.150647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0682  hypothetical protein  70.48 
 
 		 166 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0676742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3628  hypothetical protein  70.48 
 
 		 166 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3751  hypothetical protein  70.48 
 
 		 166 aa  244  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0788  hypothetical protein  70.48 
 
 		 166 aa  244  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2617  hypothetical protein  71.08 
 
 		 167 aa  240  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.808132  normal  0.759725 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0740  hypothetical protein  70.48 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000203019  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3182  hypothetical protein  69.28 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  0.0231359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0784  hypothetical protein  69.28 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.484963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0756  hypothetical protein  68.07 
 
 		 166 aa  236  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.219029  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3848  hypothetical protein  68.07 
 
 		 166 aa  236  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>