17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0784 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3182  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  340  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  normal  0.0231359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0784  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  340  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.484963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0756  hypothetical protein  98.8 
 
 		 166 aa  337  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.219029  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3848  hypothetical protein  96.39 
 
 		 166 aa  333  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0788  hypothetical protein  90.36 
 
 		 166 aa  315  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3560  hypothetical protein  90.96 
 
 		 166 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0893278  normal  0.150647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3751  hypothetical protein  90.96 
 
 		 166 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0682  hypothetical protein  90.96 
 
 		 166 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0676742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3628  hypothetical protein  90.96 
 
 		 166 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0740  hypothetical protein  81.93 
 
 		 166 aa  280  6.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000203019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2617  hypothetical protein  79.52 
 
 		 167 aa  280  8.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.808132  normal  0.759725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2970  hypothetical protein  79.52 
 
 		 166 aa  270  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00567056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0839  hypothetical protein  78.31 
 
 		 170 aa  270  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0608966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3512  hypothetical protein  75.9 
 
 		 166 aa  263  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0908  hypothetical protein  72.89 
 
 		 185 aa  259  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.329623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3180  hypothetical protein  69.28 
 
 		 166 aa  239  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.893857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4122  ribose-phosphate pyrophosphokinase  31.53 
 
 		 311 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0525218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>