56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3600 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5283  adenylate cyclase  39.96 
 
 		 951 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5222  adenylate cyclase  39.29 
 
 		 951 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0273  adenylate cyclase  40.79 
 
 		 952 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0230  adenylate cyclase, class I  38.32 
 
 		 948 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0177  adenylate cyclase  39.35 
 
 		 948 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5493  adenylate cyclase  40.73 
 
 		 947 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3600  adenylate cyclase  100 
 
 		 954 aa  1981    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0447543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6014  adenylate cyclase  39.13 
 
 		 944 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5131  adenylate cyclase  38.77 
 
 		 951 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610586  normal  0.742717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69610  adenylate cyclase  39.54 
 
 		 950 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.223743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0250  adenylate cyclase  39.62 
 
 		 954 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0492  adenylate cyclase  34.92 
 
 		 949 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2397  adenylate cyclase  33.72 
 
 		 843 aa  398  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000408129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00313  adenylate cyclase  31.81 
 
 		 842 aa  389  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0538  adenylate cyclase  29.99 
 
 		 850 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0201  adenylate cyclase  29.86 
 
 		 850 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002107  adenylate cyclase  31.24 
 
 		 842 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000191458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4015  adenylate cyclase  29.99 
 
 		 850 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0320264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4201  adenylate cyclase  29.91 
 
 		 848 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.166335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4026  adenylate cyclase  29.91 
 
 		 848 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4171  adenylate cyclase  30.04 
 
 		 848 aa  379  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4265  adenylate cyclase  29.91 
 
 		 848 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0221  adenylate cyclase  31.02 
 
 		 836 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00754404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5244  adenylate cyclase  29.91 
 
 		 848 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03630  hypothetical protein  30.04 
 
 		 848 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4173  putative adenylate cyclase  29.91 
 
 		 848 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000081012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03681  adenylate cyclase  30.04 
 
 		 848 aa  379  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0314253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4321  adenylate cyclase  29.79 
 
 		 848 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3979  adenylate cyclase  31.21 
 
 		 851 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000885251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3986  adenylate cyclase  30.04 
 
 		 847 aa  376  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4221  adenylate cyclase  29.66 
 
 		 848 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4328  adenylate cyclase  29.66 
 
 		 848 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4167  adenylate cyclase  29.66 
 
 		 848 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.028992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4152  adenylate cyclase  29.66 
 
 		 848 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4269  adenylate cyclase  29.66 
 
 		 848 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4170  adenylate cyclase  31.13 
 
 		 852 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0010483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0061  adenylate cyclase  28.59 
 
 		 861 aa  369  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0769237  normal  0.405266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0179  adenylate cyclase  29.77 
 
 		 850 aa  363  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0229  adenylate cyclase  30.75 
 
 		 851 aa  363  9e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000702171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0180  adenylate cyclase  30.7 
 
 		 852 aa  362  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000188579  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0043  adenylate cyclase  32.6 
 
 		 836 aa  327  7e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0143533  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3253  adenylate cyclase  28.17 
 
 		 809 aa  278  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.614103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0374  adenylate cyclase  26.4 
 
 		 807 aa  265  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4132  adenylate cyclase  26.15 
 
 		 807 aa  259  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.929537 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0319  adenylate cyclase  25.83 
 
 		 806 aa  257  8e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3900  adenylate cyclase  25.68 
 
 		 803 aa  254  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4093  adenylate cyclase  25.68 
 
 		 803 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0578322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3977  adenylate cyclase  25.68 
 
 		 803 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0441  adenylate cyclase  27.6 
 
 		 819 aa  249  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3586  adenylate cyclase  25.52 
 
 		 804 aa  249  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0389  adenylate cyclase  26.03 
 
 		 804 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000334339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0387  adenylate cyclase  26.03 
 
 		 804 aa  247  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00015487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3637  adenylate cyclase  25.83 
 
 		 804 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00290458  normal  0.91955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4312  adenylate cyclase  25.54 
 
 		 804 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0484  adenylate cyclase  28.76 
 
 		 807 aa  234  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00936  adenylate cyclase  28.62 
 
 		 661 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>