56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5283 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5131  adenylate cyclase  92.64 
 
 		 951 aa  1769    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610586  normal  0.742717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5222  adenylate cyclase  93.27 
 
 		 951 aa  1778    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6014  adenylate cyclase  57.79 
 
 		 944 aa  1012    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0230  adenylate cyclase, class I  67.33 
 
 		 948 aa  1295    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0177  adenylate cyclase  66.91 
 
 		 948 aa  1294    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5493  adenylate cyclase  70.43 
 
 		 947 aa  1358    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3600  adenylate cyclase  40.02 
 
 		 954 aa  684    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0447543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0273  adenylate cyclase  62.5 
 
 		 952 aa  1141    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5283  adenylate cyclase  100 
 
 		 951 aa  1927    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69610  adenylate cyclase  57.68 
 
 		 950 aa  1020    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.223743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0250  adenylate cyclase  83.58 
 
 		 954 aa  1586    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0492  adenylate cyclase  41.32 
 
 		 949 aa  634  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4321  adenylate cyclase  39.07 
 
 		 848 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4221  adenylate cyclase  38.92 
 
 		 848 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4026  adenylate cyclase  39.07 
 
 		 848 aa  452  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4201  adenylate cyclase  39.07 
 
 		 848 aa  452  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.166335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4265  adenylate cyclase  39.07 
 
 		 848 aa  452  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4173  putative adenylate cyclase  39.07 
 
 		 848 aa  452  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000081012  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4269  adenylate cyclase  38.92 
 
 		 848 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4152  adenylate cyclase  38.92 
 
 		 848 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4167  adenylate cyclase  38.92 
 
 		 848 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.028992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4328  adenylate cyclase  38.92 
 
 		 848 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5244  adenylate cyclase  39.07 
 
 		 848 aa  452  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3986  adenylate cyclase  35.97 
 
 		 847 aa  452  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03630  hypothetical protein  38.92 
 
 		 848 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302197  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03681  adenylate cyclase  38.92 
 
 		 848 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0314253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4171  adenylate cyclase  38.92 
 
 		 848 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0321888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0201  adenylate cyclase  38.28 
 
 		 850 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0538  adenylate cyclase  38.28 
 
 		 850 aa  442  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4015  adenylate cyclase  38.28 
 
 		 850 aa  442  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0320264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3979  adenylate cyclase  35.55 
 
 		 851 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000885251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0179  adenylate cyclase  35.42 
 
 		 850 aa  416  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4170  adenylate cyclase  35.24 
 
 		 852 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0010483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0229  adenylate cyclase  35.06 
 
 		 851 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000702171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2397  adenylate cyclase  34.19 
 
 		 843 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000408129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0180  adenylate cyclase  34.85 
 
 		 852 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000188579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00313  adenylate cyclase  34.16 
 
 		 842 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0221  adenylate cyclase  36.09 
 
 		 836 aa  398  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00754404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0061  adenylate cyclase  31.25 
 
 		 861 aa  395  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0769237  normal  0.405266 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002107  adenylate cyclase  33.29 
 
 		 842 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000191458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0043  adenylate cyclase  32.51 
 
 		 836 aa  333  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0143533  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4132  adenylate cyclase  31.6 
 
 		 807 aa  283  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.929537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0374  adenylate cyclase  27.71 
 
 		 807 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0387  adenylate cyclase  30.48 
 
 		 804 aa  264  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00015487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0389  adenylate cyclase  30.48 
 
 		 804 aa  264  8e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000334339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3586  adenylate cyclase  29.61 
 
 		 804 aa  262  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0319  adenylate cyclase  27.51 
 
 		 806 aa  261  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3637  adenylate cyclase  30.32 
 
 		 804 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00290458  normal  0.91955 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3253  adenylate cyclase  30.89 
 
 		 809 aa  255  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.614103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0441  adenylate cyclase  28.82 
 
 		 819 aa  255  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0484  adenylate cyclase  29.17 
 
 		 807 aa  251  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4312  adenylate cyclase  29.61 
 
 		 804 aa  251  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3900  adenylate cyclase  28.8 
 
 		 803 aa  243  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4093  adenylate cyclase  28.48 
 
 		 803 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0578322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3977  adenylate cyclase  28.48 
 
 		 803 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00936  adenylate cyclase  26.67 
 
 		 661 aa  220  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>