56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0229 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4269  adenylate cyclase  82.16 
 
 
848 aa  1457    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0201  adenylate cyclase  83.47 
 
 
850 aa  1482    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00313  adenylate cyclase  54.9 
 
 
842 aa  931    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4026  adenylate cyclase  81.87 
 
 
848 aa  1464    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03681  adenylate cyclase  81.75 
 
 
848 aa  1462    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0314253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0179  adenylate cyclase  86.04 
 
 
850 aa  1486    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638545  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0538  adenylate cyclase  83.47 
 
 
850 aa  1480    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4015  adenylate cyclase  83.47 
 
 
850 aa  1480    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0320264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4201  adenylate cyclase  81.87 
 
 
848 aa  1464    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.166335  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4171  adenylate cyclase  81.75 
 
 
848 aa  1462    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0321888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4265  adenylate cyclase  81.87 
 
 
848 aa  1464    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4221  adenylate cyclase  82.16 
 
 
848 aa  1457    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854898  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4321  adenylate cyclase  81.75 
 
 
848 aa  1462    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4152  adenylate cyclase  82.16 
 
 
848 aa  1456    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4167  adenylate cyclase  82.16 
 
 
848 aa  1457    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.028992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4328  adenylate cyclase  82.16 
 
 
848 aa  1457    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0221  adenylate cyclase  51.08 
 
 
836 aa  855    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00754404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5244  adenylate cyclase  81.87 
 
 
848 aa  1464    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0229  adenylate cyclase  100 
 
 
851 aa  1773    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000702171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03630  hypothetical protein  81.75 
 
 
848 aa  1462    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0180  adenylate cyclase  92.72 
 
 
852 aa  1616    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000188579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3979  adenylate cyclase  87.31 
 
 
851 aa  1538    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000885251  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4170  adenylate cyclase  86.97 
 
 
852 aa  1526    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0010483  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002107  adenylate cyclase  54.36 
 
 
842 aa  926    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000191458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4173  putative adenylate cyclase  81.87 
 
 
848 aa  1464    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000081012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2397  adenylate cyclase  54.9 
 
 
843 aa  926    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000408129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3986  adenylate cyclase  82.39 
 
 
847 aa  1462    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0061  adenylate cyclase  45.37 
 
 
861 aa  754    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0769237  normal  0.405266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0043  adenylate cyclase  43.82 
 
 
836 aa  697    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0143533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0250  adenylate cyclase  36 
 
 
954 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0230  adenylate cyclase, class I  33.74 
 
 
948 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5222  adenylate cyclase  38.42 
 
 
951 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5131  adenylate cyclase  36.01 
 
 
951 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610586  normal  0.742717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0177  adenylate cyclase  36.09 
 
 
948 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5283  adenylate cyclase  35.06 
 
 
951 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0374  adenylate cyclase  33.54 
 
 
807 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5493  adenylate cyclase  33.33 
 
 
947 aa  422  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0319  adenylate cyclase  31.81 
 
 
806 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4132  adenylate cyclase  32.27 
 
 
807 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.929537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3253  adenylate cyclase  32.81 
 
 
809 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.614103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3586  adenylate cyclase  30.72 
 
 
804 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0273  adenylate cyclase  36.43 
 
 
952 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69610  adenylate cyclase  35.44 
 
 
950 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.223743  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0389  adenylate cyclase  30.94 
 
 
804 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000334339  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3637  adenylate cyclase  30.82 
 
 
804 aa  399  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00290458  normal  0.91955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6014  adenylate cyclase  33.75 
 
 
944 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0387  adenylate cyclase  30.57 
 
 
804 aa  396  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00015487  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4312  adenylate cyclase  31.09 
 
 
804 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3977  adenylate cyclase  30.88 
 
 
803 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4093  adenylate cyclase  30.88 
 
 
803 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0578322 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3900  adenylate cyclase  30.64 
 
 
803 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0484  adenylate cyclase  30.56 
 
 
807 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379566  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3600  adenylate cyclase  30.75 
 
 
954 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0447543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0492  adenylate cyclase  31.23 
 
 
949 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0441  adenylate cyclase  29.06 
 
 
819 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00936  adenylate cyclase  25.37 
 
 
661 aa  193  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>