90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0085 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0085  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  100 
 
 		 172 aa  361  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1623  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  64.23 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.155536  normal  0.677991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1771  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  53.46 
 
 		 159 aa  167  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2382  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  50.62 
 
 		 161 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00696748  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1944  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  50.62 
 
 		 161 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00204766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1911  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  49.38 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0762568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1904  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  52.9 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1937  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  50 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00179151  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1843  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  54.55 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.375611  hitchhiker  0.000197655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2134  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  51.95 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271627 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1901  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  51.95 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2426  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  50.3 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.882543  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1056  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type subunit  48.41 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2679  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  59.35 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.445618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2552  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  52.67 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1498  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  52.29 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.819439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1861  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  57.85 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.368845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0953  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  55.2 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2982  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  58.47 
 
 		 161 aa  148  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00775357  normal  0.0698928 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4764  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  57.38 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369311  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4062  nitrate reductase cytochrome c-type subunit  54.69 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0531766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4206  cytochrome c-type protein NapB precursor  49.65 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49260  cytochrome c-type protein NapB precursor  54.24 
 
 		 163 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.041418  normal  0.0353709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1018  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  55.75 
 
 		 152 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5181  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  59.79 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2845  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  53.6 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2937  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  56.31 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2439  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  53.6 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4117  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  53.15 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0368  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  50.85 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181972 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3991  hypothetical protein  55 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0187706  normal  0.3713 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4722  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  45.58 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0507441  normal  0.0973105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2173  nitrate reductase periplasmic cytochrome c-type subunit NapB  42.38 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4006  Resolvase domain protein  39.76 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1340  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  41.72 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2365  cytochrome C-type protein NapB precursor  42.04 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00904939  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1588  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  41.5 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1914  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  41.72 
 
 		 150 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  normal  0.893468 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000514  nitrate reductase cytochrome c550-type subunit  41.03 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.517627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05376  cytochrome c-type protein NapB  41.03 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3162  cytochrome c-type protein NapB  39.04 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3219  polyferredoxin-like protein  41.33 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3514  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  39.84 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640851  normal  0.0181495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3485  citrate reductase cytochrome c-type subunit  41.26 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0618  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  38.46 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1447  citrate reductase cytochrome c-type subunit  36.67 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3340  citrate reductase cytochrome c-type subunit  36.67 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.938627  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1456  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  36.67 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02130  nitrate reductase, small, cytochrome C550 subunit, periplasmic  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.394673  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2440  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.272341  normal  0.388304 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2496  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370778 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02089  hypothetical protein  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335316  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0738  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825181  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2482  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2391  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2599  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.418817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2351  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2502  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2341  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.22 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2789  citrate reductase cytochrome c-type subunit  44.68 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0379212 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1388  citrate reductase cytochrome c-type subunit  44.68 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763075  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1274  citrate reductase cytochrome c-type subunit  44.68 
 
 		 151 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2414  citrate reductase cytochrome c-type subunit  36.55 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2718  citrate reductase cytochrome c-type subunit  36.55 
 
 		 145 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1505  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  34.27 
 
 		 140 aa  87.4  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4111  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  32.05 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0858  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  40.43 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3151  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  41.57 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3512  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  36.44 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.565574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0846  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  41.57 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0846811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0823  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  42.35 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.132377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0620  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  34.44 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0845  cytochrome c-type protein NapB  35.9 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3209  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  31.13 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3433  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  35.29 
 
 		 143 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0175651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3321  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  35.29 
 
 		 143 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0647827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0701  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  34.45 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0441  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  40 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2986  cytochrome c-type protein NapB  41.18 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1158  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  33.85 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.232212  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0804  periplasmic nitrate reductase, small subunit  39.56 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112937  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0874  periplasmic nitrate reductase, small subunit  40.66 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0727  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  28.29 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000042216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0552  cytochrome c-type protein NapB  29.17 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.219283  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3960  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  32.03 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1719  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  34.41 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1015  periplasmic nitrate reductase, small subunit, cytochrome c-type protein  31.29 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1517  periplasmic nitrate reductase  28.95 
 
 		 236 aa  51.2  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000041179  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1931  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  36.96 
 
 		 175 aa  50.8  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0865  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  36.96 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>