90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2439 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2439  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  100 
 
 		 167 aa  347  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2845  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  98.8 
 
 		 167 aa  344  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4764  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  66.08 
 
 		 168 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369311  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4062  nitrate reductase cytochrome c-type subunit  71.21 
 
 		 163 aa  207  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0531766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0368  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  51.77 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1623  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  53.74 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.155536  normal  0.677991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1901  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  46.01 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726566 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1843  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  46.63 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.375611  hitchhiker  0.000197655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1904  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  46.91 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2134  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  45.4 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49260  cytochrome c-type protein NapB precursor  57.26 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.041418  normal  0.0353709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4206  cytochrome c-type protein NapB precursor  57.26 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1771  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  46.15 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2552  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  49.06 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1861  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  50 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.368845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1056  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type subunit  47.13 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2426  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  48.41 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.882543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1937  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  45.96 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00179151  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1911  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  44.72 
 
 		 161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0762568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2382  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  45.34 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00696748  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1944  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  45.34 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00204766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0953  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  50 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1498  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  49.66 
 
 		 156 aa  135  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.819439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2982  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  52.76 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00775357  normal  0.0698928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1018  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  51.56 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0085  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  46.88 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2679  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  51.28 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.445618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5181  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  44.44 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2937  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  46.98 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2365  cytochrome C-type protein NapB precursor  43.62 
 
 		 157 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00904939  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4722  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  48.63 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0507441  normal  0.0973105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1588  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  40.13 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2173  nitrate reductase periplasmic cytochrome c-type subunit NapB  39.47 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1914  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  43.04 
 
 		 150 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  normal  0.893468 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3219  polyferredoxin-like protein  45.07 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4117  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  51.33 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0618  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  47.24 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4006  Resolvase domain protein  51.06 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3485  citrate reductase cytochrome c-type subunit  43.8 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3991  hypothetical protein  53.54 
 
 		 138 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0187706  normal  0.3713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3514  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  42.98 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640851  normal  0.0181495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1340  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  44.44 
 
 		 161 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000514  nitrate reductase cytochrome c550-type subunit  44.8 
 
 		 152 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.517627  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05376  cytochrome c-type protein NapB  44.8 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0738  citrate reductase cytochrome c-type subunit  40.85 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2351  citrate reductase cytochrome c-type subunit  40.85 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02089  hypothetical protein  40.85 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2502  citrate reductase cytochrome c-type subunit  40.85 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02130  nitrate reductase, small, cytochrome C550 subunit, periplasmic  40.85 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.394673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2341  citrate reductase cytochrome c-type subunit  40.85 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1456  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  40.85 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3162  cytochrome c-type protein NapB  44.44 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1447  citrate reductase cytochrome c-type subunit  40.85 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3340  citrate reductase cytochrome c-type subunit  40.85 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.938627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2718  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.11 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2414  citrate reductase cytochrome c-type subunit  51.11 
 
 		 145 aa  102  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1274  citrate reductase cytochrome c-type subunit  38.64 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2789  citrate reductase cytochrome c-type subunit  38.64 
 
 		 155 aa  101  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0379212 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1388  citrate reductase cytochrome c-type subunit  38.64 
 
 		 155 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763075  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2391  citrate reductase cytochrome c-type subunit  38.73 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2482  citrate reductase cytochrome c-type subunit  38.73 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2496  citrate reductase cytochrome c-type subunit  38.73 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2440  citrate reductase cytochrome c-type subunit  38.73 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.272341  normal  0.388304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2599  citrate reductase cytochrome c-type subunit  38.73 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.418817 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1505  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  41.12 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3151  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  36.18 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0858  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  46.08 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0846  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  45.1 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0846811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0845  cytochrome c-type protein NapB  36.84 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3512  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  46.08 
 
 		 143 aa  88.6  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.565574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2986  cytochrome c-type protein NapB  38.93 
 
 		 143 aa  88.2  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3321  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  36.84 
 
 		 143 aa  87.8  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0647827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3433  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  36.18 
 
 		 143 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0175651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0701  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  36.18 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0823  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  45.45 
 
 		 143 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.132377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0874  periplasmic nitrate reductase, small subunit  48.42 
 
 		 173 aa  85.5  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0804  periplasmic nitrate reductase, small subunit  47.37 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112937  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1015  periplasmic nitrate reductase, small subunit, cytochrome c-type protein  46.32 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4111  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  37.25 
 
 		 142 aa  84.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0620  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  38.41 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0552  cytochrome c-type protein NapB  45.45 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.219283  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0441  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  41.76 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107378  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0727  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  36.44 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000042216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3209  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  39.68 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1158  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  44.44 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.232212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1719  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  40.22 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3960  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  32.68 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359336 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0865  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  36.56 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1931  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  36.56 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1517  periplasmic nitrate reductase  30.91 
 
 		 236 aa  52.4  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000041179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>