89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2982 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2982  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  100 
 
 		 161 aa  333  7.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00775357  normal  0.0698928 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49260  cytochrome c-type protein NapB precursor  74.83 
 
 		 163 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.041418  normal  0.0353709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4206  cytochrome c-type protein NapB precursor  74.31 
 
 		 163 aa  231  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0085  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  50.61 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0953  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  57.6 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1056  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type subunit  43.98 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1861  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  58.33 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.368845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1771  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  48.1 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2679  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  56.14 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.445618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1018  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  50.66 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1623  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  58.49 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.155536  normal  0.677991 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4764  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  53.72 
 
 		 168 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369311  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5181  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  48.98 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2134  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  56.6 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1843  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  56.6 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.375611  hitchhiker  0.000197655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1904  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  55.66 
 
 		 161 aa  141  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1901  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  56.6 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2552  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  55.05 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1498  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  55.96 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.819439  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4062  nitrate reductase cytochrome c-type subunit  52.94 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0531766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2426  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  51.33 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.882543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1944  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  46 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00204766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2382  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  46 
 
 		 161 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00696748  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1911  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  45.33 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0762568  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1937  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  45.33 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00179151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2439  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  51.94 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2845  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  54.31 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2937  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  55.05 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4722  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  60 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0507441  normal  0.0973105 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0368  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  41.96 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181972 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4117  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  58.49 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3991  hypothetical protein  54.07 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0187706  normal  0.3713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2173  nitrate reductase periplasmic cytochrome c-type subunit NapB  57.14 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05376  cytochrome c-type protein NapB  41.94 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000514  nitrate reductase cytochrome c550-type subunit  43.23 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.517627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2365  cytochrome C-type protein NapB precursor  39.87 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00904939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1914  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  52.75 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  normal  0.893468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4006  Resolvase domain protein  51.65 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0618  periplasmic nitrate reductase, cytochrome c-type protein  50.55 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3485  citrate reductase cytochrome c-type subunit  53.41 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0885059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1588  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  49 
 
 		 152 aa  107  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1447  citrate reductase cytochrome c-type subunit  54.02 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2351  citrate reductase cytochrome c-type subunit  54.02 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1388  citrate reductase cytochrome c-type subunit  52.27 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1340  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  45.13 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0738  citrate reductase cytochrome c-type subunit  54.02 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.825181  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2789  citrate reductase cytochrome c-type subunit  52.27 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0379212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3340  citrate reductase cytochrome c-type subunit  54.02 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.938627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02089  hypothetical protein  54.02 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335316  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1456  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  54.02 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2502  citrate reductase cytochrome c-type subunit  54.02 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2341  citrate reductase cytochrome c-type subunit  54.02 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02130  nitrate reductase, small, cytochrome C550 subunit, periplasmic  54.02 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.394673  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1274  citrate reductase cytochrome c-type subunit  52.27 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3514  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  48.24 
 
 		 146 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640851  normal  0.0181495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2440  citrate reductase cytochrome c-type subunit  52.87 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.272341  normal  0.388304 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2496  citrate reductase cytochrome c-type subunit  52.87 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2482  citrate reductase cytochrome c-type subunit  52.87 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2391  citrate reductase cytochrome c-type subunit  52.87 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2599  citrate reductase cytochrome c-type subunit  52.87 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.418817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3162  cytochrome c-type protein NapB  45 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3219  polyferredoxin-like protein  47.52 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1505  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  51.19 
 
 		 140 aa  97.8  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2414  citrate reductase cytochrome c-type subunit  49.43 
 
 		 145 aa  97.8  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2718  citrate reductase cytochrome c-type subunit  49.43 
 
 		 145 aa  97.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3151  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  34.03 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0781022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0858  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  34.72 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2986  cytochrome c-type protein NapB  35.21 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0701  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  35.42 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0874  periplasmic nitrate reductase, small subunit  40.66 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0823  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  34.51 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.132377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0804  periplasmic nitrate reductase, small subunit  41.76 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.112937  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3433  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  34.72 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0175651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0845  cytochrome c-type protein NapB  43.02 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3321  periplasmic nitrate reductase subunit NapB  34.03 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0647827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3512  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  37.04 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.565574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0846  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  34.03 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0846811 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0552  cytochrome c-type protein NapB  32.39 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.219283  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1015  periplasmic nitrate reductase, small subunit, cytochrome c-type protein  35.96 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0441  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  37.78 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4111  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  36.36 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3209  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  31.25 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0865  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  38.04 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1931  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  36.96 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1158  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  34 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.232212  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1719  periplasmic nitrate reductase, diheme cytochrome c subunit  34.07 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0727  Nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  32.18 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000042216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0620  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  35.79 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3960  nitrate reductase cytochrome c-type subunit (NapB)  36.36 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0359336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>