34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4748 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3786  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  99.52 
 
 		 621 bp  1207    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000283626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04079  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase)  97.26 
 
 		 621 bp  1096    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000947003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04042  hypothetical protein  97.26 
 
 		 621 bp  1096    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000898857  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5724  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  99.36 
 
 		 621 bp  1199    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000053237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4748    100 
 
 		 621 bp  1231    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000766096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4457  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  99.03 
 
 		 621 bp  1183    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000966662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4775  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  99.36 
 
 		 621 bp  1199    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  98.23 
 
 		 621 bp  1144    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3799  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  97.1 
 
 		 621 bp  1088    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000238479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4757  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  86.07 
 
 		 621 bp  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000289999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4665  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  85.74 
 
 		 621 bp  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000013658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4815  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  85.74 
 
 		 621 bp  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000233687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4793  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  85.74 
 
 		 663 bp  519  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.015045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4675  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  85.58 
 
 		 621 bp  517  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480712  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0377  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  85.09 
 
 		 621 bp  494  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000444848  normal  0.152063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3585  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  80.69 
 
 		 621 bp  157  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000341451  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0780  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  85.23 
 
 		 621 bp  143  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3428  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  79.4 
 
 		 621 bp  117  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0452  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  83.24 
 
 		 621 bp  113  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.304898  hitchhiker  0.00456401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0800  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  80.62 
 
 		 621 bp  101  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000446702  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3778  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  82.39 
 
 		 621 bp  93.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3954    82.39 
 
 		 621 bp  93.7  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3633  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  82.39 
 
 		 621 bp  93.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0715  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  83.53 
 
 		 618 bp  58  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0142826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0716  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  96.67 
 
 		 618 bp  52  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4501  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  96.67 
 
 		 618 bp  52  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5212  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FklB  94.12 
 
 		 618 bp  52  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000429997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0965  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  83.33 
 
 		 618 bp  52  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000577279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60500  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FklB  94.12 
 
 		 618 bp  52  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00448374  normal  0.508469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1001  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  83.33 
 
 		 618 bp  52  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000102851  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0684  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  82.35 
 
 		 618 bp  50.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.290597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0956  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  96.55 
 
 		 474 bp  50.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.182091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3077  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  83.12 
 
 		 618 bp  50.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760442  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3462  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FklB  86.54 
 
 		 642 bp  48.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.164009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>