17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0412 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0412  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2318  hypothetical protein  61.19 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.272642  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1922  hypothetical protein  66.67 
 
 
68 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0068  hypothetical protein  50.79 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.471063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4186  hypothetical protein  53.85 
 
 
97 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1027  hypothetical protein  55.56 
 
 
72 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2688  hypothetical protein  55.56 
 
 
59 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0965838  normal  0.349266 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0201  hypothetical protein  59.26 
 
 
59 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1680  hypothetical protein  55.56 
 
 
60 aa  60.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2912  hypothetical protein  52.83 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2761  hypothetical protein  51.85 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622446  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1854  hypothetical protein  54.55 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12532  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0702  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00942627  hitchhiker  0.000000331825 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0546  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.823502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2845  hypothetical protein  43.33 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01400  conserved hypothetical protein  45 
 
 
144 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1505  hypothetical protein  42.31 
 
 
75 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>